1. qs世界大学排名
由教育组织quacquarelli symonds所发表的《qs世界大学排名》，和由泰晤士高等教育组织发表的《泰晤士高等教育世界大学排名》被公认为世界影响力的全球性大学排名之一。这两个世界大学排名对日本大学的排名在很大程度上决定了日本的大学在国际上认可度。
2015~2016年qs公布的世界大学排名中，日本共有10所大学进入200强行列，分别是：
38、京都大学
39、东京大学
56、东京工业大学
58、大阪大学
74、日本东北大学
120、名古屋大学
139、北海道大学
142、九州大学
2. 泰晤士高等教育世界大学排名
2015年的泰晤士高等教育世界大学排名，日本共有5所大学进入200的行列，其中东京大学在亚洲地区排名第一，世界排名23位。在该排名中，日本、香港和中国内地各有5所、4所和3所高校进入前200名。
日本进入200强行列的大学：
东京大学（23位）
京都大学（59位）
东京工业大学（141位）
大阪大学（157位）
东北大学（165位）
3. 2014~2015年泰晤士高等教育亚洲大学排名
东京大学排名第一位，京都大学排名第六，都位列前10强。中国大陆仅有3所院校入围前100强，总数低于日本。中国高校中排名第一的是北京大学，在此次排名中位列第三名，清华大学紧随其后位列第四。
日本上榜前二十的5所大学：
东京大学（1）
京都大学（6）
东京工业大学（10）
大阪大学（13）
东北大学（14）
